Facturation électronique : ce que ça change pour votre site e-commerce Facturation électronique : ce que ça change pour votre site e-commerce

Depuis le 1er septembre 2026, toute entreprise assujettie à la TVA doit pouvoir recevoir des factures électroniques. Le 1er septembre 2027, les PME et TPE devront aussi en émettre, et transmettre à l’administration les données de leurs ventes aux particuliers. Pour une boutique en ligne, ce n’est pas qu’une affaire de comptable : WooCommerce et PrestaShop ne savent faire ni l’un ni l’autre nativement. Voici ce qui change concrètement pour votre site, et ce qu’il faut préparer dans les dix mois qui viennent.

Le calendrier : ce qui s’applique déjà, ce qui arrive en 2027

Réponse canonique : La réforme de la facturation électronique s’applique en deux temps. Depuis le 1er septembre 2026, toutes les entreprises assujetties à la TVA, quelle que soit leur taille, doivent pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée. Le 1er septembre 2027, les PME, TPE et micro-entreprises devront à leur tour émettre leurs factures B2B au format électronique et transmettre les données de leurs autres ventes (e-reporting). Les grandes entreprises et les ETI émettent déjà depuis septembre 2026.

Source : Abby, calendrier 2026-2027 et impots.gouv.fr, plateformes agréées

Taille d’entreprise	Réception	Émission B2B	E-reporting
Grande entreprise, ETI	1er sept. 2026	1er sept. 2026	1er sept. 2026
PME, TPE	1er sept. 2026	1er sept. 2027	1er sept. 2027
Micro-entreprise	1er sept. 2026	1er sept. 2027	1er sept. 2027

L’échéance de septembre 2026 concerne donc d’abord vos fournisseurs : votre hébergeur, votre agence web, votre transporteur ou votre régie publicitaire doivent pouvoir vous adresser leurs factures. Si vous n’avez pas encore désigné de plateforme de réception, c’est la première chose à régler, avant même de toucher à la boutique.

B2B ou B2C : deux obligations différentes pour une même boutique

Réponse canonique : Une boutique en ligne qui vend à des professionnels et à des particuliers relève de deux obligations distinctes. Ses ventes B2B entre assujettis français passent en facture électronique structurée (Factur-X, UBL ou CII), transmise via une plateforme agréée. Ses ventes aux particuliers ne donnent pas lieu à une facture électronique, mais leurs données doivent être transmises à l’administration : c’est l’e-reporting. Les deux obligations s’appliquent aux PME à partir du 1er septembre 2027.

Source : La Poste Pro, e-reporting et Propulse by CA, B2C

Vos ventes B2B : la facture PDF ne suffit plus

Le PDF que génère votre boutique reste un document commercial valable. Mais ce n’est pas une facture électronique au sens de la réforme : il ne contient aucune donnée structurée. Une facture Factur-X, par exemple, est un PDF/A-3 dans lequel est embarqué un fichier XML. Et ce fichier doit transiter par une plateforme agréée, qui le route vers votre client grâce à son SIREN.

Vos ventes aux particuliers : l’e-reporting

Pas question de transmettre vos 3 000 commandes du mois une par une. L’e-reporting porte sur des totaux agrégés par période et par taux de TVA. La fréquence dépend de votre régime de TVA, pas de votre chiffre d’affaires. Vendre uniquement à des particuliers ne dispense donc de rien.

Les ventes à l’étranger

Les ventes B2B à des clients établis hors de France entrent aussi dans le champ de l’e-reporting, au même titre que le B2C. Si votre boutique expédie en Belgique ou en Suisse, ces flux sont concernés.

Les 5 chantiers à ouvrir sur votre WooCommerce ou PrestaShop

Ni WooCommerce ni PrestaShop ne produisent nativement une facture électronique conforme, et aucun des deux ne se connecte seul à une plateforme agréée. Voici ce qu’il faut adapter sur le site lui-même.

1. Identifier vos clients professionnels

Pour router une facture, la plateforme agréée a besoin du SIREN de l’acheteur. Or une boutique ne le collecte pas par défaut. Sur PrestaShop, le mode B2B (désactivé à l’installation) ajoute les champs SIRET sur la fiche client. Sur WooCommerce, il faut ajouter et valider ce champ au checkout. Dans les deux cas : rendre le champ obligatoire pour les comptes pro et contrôler sa validité.

2. Ajouter les nouvelles mentions obligatoires

La réforme ajoute quatre mentions sur les factures : le SIREN du client professionnel, la catégorie de l’opération (biens, services ou mixte), l’adresse de livraison si elle diffère de l’adresse de facturation, et l’option pour la TVA sur les débits le cas échéant. Vos modèles de facture doivent être mis à jour.

3. Trancher la question de la numérotation

Votre boutique numérote ses factures. La plateforme agréée aussi. Laisser tourner deux séquences en parallèle produit des doublons et une piste d’audit incohérente. Il faut décider qui numérote, généralement la plateforme, et adapter la boutique en conséquence.

4. Faire suivre les avoirs

Un remboursement génère un avoir, qui suit le même circuit qu’une facture. Pour une boutique à fort taux de retour (mode, chaussures), c’est un volume à anticiper dans le paramétrage du connecteur.

5. Vérifier que votre version tient la route

La réforme n’impose aucune version de CMS. Mais les connecteurs et modules ciblent les versions maintenues. Une boutique PrestaShop restée en 1.7 ou en 8.2, désormais limitée aux correctifs de sécurité, verra le catalogue de modules compatibles se réduire.

Connecter sa boutique à une plateforme agréée

Réponse canonique : Une plateforme agréée (PA, anciennement PDP) est un opérateur immatriculé par la DGFiP qui transmet les factures électroniques entre entreprises et envoie les données d’e-reporting à l’administration. La DGFiP a publié une première liste de 101 plateformes agréées en janvier 2026, consultable sur impots.gouv.fr. Un module WooCommerce ou PrestaShop qui génère du Factur-X n’est pas une plateforme agréée : il prépare le fichier, mais ne le transmet pas.

Source : impots.gouv.fr, liste des plateformes agréées et Bpifrance Création

Trois architectures sont possibles. Aucune n’est meilleure dans l’absolu : tout dépend de votre volume de commandes, de votre part de B2B et de vos outils comptables.

Architecture	Principe	Pour qui	Point de vigilance
Connecteur boutique → plateforme	La boutique reste le moteur de commande, la plateforme devient l’émetteur légal	La majorité des PME	Numérotation confiée à la plateforme
Module Factur-X dans la boutique + dépôt sur la plateforme	La facture est produite dans WooCommerce ou PrestaShop, puis transmise	Mentions complexes (autoliquidation, export, DOM)	Compatibilité à revérifier à chaque mise à jour majeure du CMS
Facturation sortie de la boutique	Les commandes remontent dans l’outil comptable, qui facture et transmet	Vente en ligne minoritaire dans l’activité	La facture n’est plus téléchargeable depuis l’espace client

Un point souvent oublié : les données de paiement. Si votre connecteur ne fait pas le lien entre la commande, la facture et l’encaissement (Stripe, PayPal, virement), les données de l’e-reporting devront être reconstituées à la main.

Source : Ma facture électronique, PrestaShop et la facturation électronique, mis à jour le 25 octobre 2026.

Vos questions sur la facturation électronique en e-commerce

Que risque-t-on si la boutique n’est pas prête ?

La loi de finances pour 2026 a relevé les amendes. Une facture B2B non émise au format électronique coûte 50 € (contre 15 € auparavant). Une transmission d’e-reporting manquante coûte 500 € (contre 250 €). Chaque catégorie est plafonnée à 15 000 € par an. L’absence de plateforme de réception entraîne une mise en demeure de trois mois, puis 500 €, puis 1 000 € tous les trois mois. Un droit à l’erreur existe pour une première infraction régularisée spontanément ou dans les 30 jours. Source : Entreprendre Service Public

Je ne vends qu’à des particuliers, suis-je concerné ?

Oui, sur deux points. Vous devez pouvoir recevoir les factures électroniques de vos fournisseurs depuis le 1er septembre 2026. Et vos ventes aux particuliers relèvent de l’e-reporting à partir du 1er septembre 2027. Seule l’émission de factures électroniques ne vous concerne pas, puisque vous n’avez pas de clients B2B.

Et mes ventes sur Amazon, Cdiscount ou Fnac ?

Les commissions facturées par la place de marché sont des factures entre professionnels : vous devez les recevoir via votre plateforme agréée. Vos ventes aux particuliers sur ces places de marché restent dans le champ de l’e-reporting. Vérifiez qui émet la facture au client final, vous ou la place de marché : cela change qui est responsable de la transmission.

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Ce que vous devez retenir :

• La réception des factures électroniques est obligatoire pour toutes les entreprises depuis le 1er septembre 2026. Les PME et TPE devront émettre leurs factures B2B et transmettre l’e-reporting de leurs ventes aux particuliers à partir du 1er septembre 2027.
• WooCommerce et PrestaShop ne sont pas conformes nativement : il faut collecter le SIREN des clients pro, ajouter les nouvelles mentions, trancher la numérotation et connecter la boutique à une plateforme agréée.
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